三峡工程所需投资，静态（按１９９３年５月末不变价）９００．９亿元人民币，（其中：枢纽工程５００．９亿元，库区移民工程４００亿元）。动态（预测物价、利息变动等因素）为２０３９亿元。一期工程（大江截流前）约需１９５亿元；二期工程（首批机组开始发电）需３４０亿元；三期工程（全部机组投入运行）约需３５０亿元；库区移民的收尾项目约需６９亿元。考虑物价上涨和贷款利息，工程的最终投资总额预计在２０００亿元左右。其中８００亿元靠施工期间发电收入补充。

    建设资金分三个阶段：１、纯投入阶段，第１年至第１１年（１９９３—２００３年）。２、投入—产出阶段，２００３年首批机组发电后开始有资金收入，至第１３年（２００５年），当年发电收入加上三峡工程建设基金和葛洲坝电厂利润收入，与当年资金需求达到平衡，该年为资金平衡年。３、产出—还贷阶段。三峡工程从第１４年（２００６年）起工程出现资金盈余，开始偿还贷款本息。据初步测算，２０１０年以后，可还清全部贷款本息。其资金来源主要立足于中国国内，采取多渠道、多种形式融集资金来解决。

    中国政府在资金筹措方面出台了三项扶持政策。一是将葛洲坝发电厂划归三峡工程业主 ──中国长江三陕工程开发总公司，其发电利润用于三陕工程建设，此外，适当提高其上网电价，增加的收入也用于三陕工程建设。二是在全国范围内，按不同地区、不同标准，通过对用户用电适当加价的办法，征收三陕工程建设基金。以上两项在三峡工程建设期内可筹集资金约１１００亿元人民币，占三峡工程总投资的５０％以上。三是国家开发银行贷款，国家开发银行已承诺在１９９４年至２００３年每年向三陕工程贷款３０亿元，共计３００亿元人民币。以上三项政策可为三陕工程筹集建设基金１４００多亿元，约占工程总投资的７０％。这是三峡工程稳定可靠的资金来源，对整个工程建设起着重要的资金支撑作用。

    除此之外，三峡工程从２００３年起，机组相继投产，从而能从售电中为三峡工程增加新的资金来源。其余少量资金拟从国内外资本市场筹集。不足部分，拟通过出口信贷和发债方式在国际资本市场上解决。

    １９９７年１月，国家计划委员会正式批准三峡债券发行计划。同年２月，中国长江三峡工程开发总公司在国内首次发行三峡工程债券，发债额度为１０亿元人民币。